Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSHZ2Q9NRE2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSHZ2Q9NRE2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSHZ2Q9NRE2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms