Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM7Q9NR12 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM7Q9NR12 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms