Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP3Q9H6T3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP3Q9H6T3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms