Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
PCGF6Q9BYE7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PCGF6Q9BYE7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PCGF6Q9BYE7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms