Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms