Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SORT1Q99523 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SORT1Q99523 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SORT1Q99523 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SORT1Q99523 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SORT1Q99523 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SORT1Q99523 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SORT1Q99523 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORT1Q99523 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORT1Q99523 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORT1Q99523 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORT1Q99523 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORT1Q99523 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORT1Q99523 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SORT1Q99523 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORT1Q99523 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORT1Q99523 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SORT1Q99523 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SORT1Q99523 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SORT1Q99523 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORT1Q99523 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORT1Q99523 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORT1Q99523 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SORT1Q99523 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SORT1Q99523 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SORT1Q99523 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SORT1Q99523 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SORT1Q99523 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SORT1Q99523 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SORT1Q99523 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORT1Q99523 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SORT1Q99523 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SORT1Q99523 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORT1Q99523 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SORT1Q99523 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SORT1Q99523 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORT1Q99523 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORT1Q99523 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SORT1Q99523 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SORT1Q99523 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORT1Q99523 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SORT1Q99523 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SORT1Q99523 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SORT1Q99523 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SORT1Q99523 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SORT1Q99523 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORT1Q99523 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORT1Q99523 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SORT1Q99523 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORT1Q99523 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SORT1Q99523 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORT1Q99523 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms