Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBGCP5Q96RT8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms