Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM44Q96DX7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM44Q96DX7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms