Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCFD1Q8WVM8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCFD1Q8WVM8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCFD1Q8WVM8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCFD1Q8WVM8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCFD1Q8WVM8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms