Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PLD3Q8IV08 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLD3Q8IV08 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLD3Q8IV08 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms