Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

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Length 78 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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CSAG1Q6PB30 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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CSAG1Q6PB30 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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CSAG1Q6PB30 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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CSAG1Q6PB30 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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CSAG1Q6PB30 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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