Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms