Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBAP2Q5T6F2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBAP2Q5T6F2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms