Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms