Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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SSX2Q16385 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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SSX2Q16385 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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SSX2Q16385 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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SSX2Q16385 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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SSX2Q16385 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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SSX2Q16385 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SSX2Q16385 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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SSX2Q16385 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX2Q16385 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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