Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGA3Q16281 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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