Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD3Q15059 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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