Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNTA1Q13424 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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