Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFFO1Q0D2I5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFFO1Q0D2I5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFFO1Q0D2I5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms