Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC38A11Q08AI6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms