Protein–RNA interactions for Protein: P84103

SRSF3, Serine/arginine-rich splicing factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF3P84103 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF3P84103 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF3P84103 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms