Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIM1P81133 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIM1P81133 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIM1P81133 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIM1P81133 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIM1P81133 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIM1P81133 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIM1P81133 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIM1P81133 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIM1P81133 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIM1P81133 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIM1P81133 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIM1P81133 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIM1P81133 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIM1P81133 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIM1P81133 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIM1P81133 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIM1P81133 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIM1P81133 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIM1P81133 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIM1P81133 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIM1P81133 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIM1P81133 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIM1P81133 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIM1P81133 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIM1P81133 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIM1P81133 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIM1P81133 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIM1P81133 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIM1P81133 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIM1P81133 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIM1P81133 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIM1P81133 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIM1P81133 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIM1P81133 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIM1P81133 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIM1P81133 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIM1P81133 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIM1P81133 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIM1P81133 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIM1P81133 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIM1P81133 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIM1P81133 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIM1P81133 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIM1P81133 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIM1P81133 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIM1P81133 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIM1P81133 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIM1P81133 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIM1P81133 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIM1P81133 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIM1P81133 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIM1P81133 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIM1P81133 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIM1P81133 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIM1P81133 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIM1P81133 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms