Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.267e-8■■■■■ 30.6
AARSP49588 AP1G2-205ENST00000535852 2471 ntTSL 1 (best)13.4□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MSH5-SAPCD1-205ENST00000476085 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.39□□□□□ -0.274e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.274e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MYO19-213ENST00000614623 4054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-217ENST00000483310 755 ntTSL 313.16□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-223ENST00000496438 699 ntTSL 513.15□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MYO19-214ENST00000615902 559 ntTSL 313.02□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 VPS51-210ENST00000531146 594 ntTSL 213.02□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 AP1G2-217ENST00000555118 362 ntTSL 512.94□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HERC1-202ENST00000558324 828 ntTSL 512.92□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RNF123-209ENST00000486102 4564 ntTSL 1 (best)12.91□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 CNN2-207ENST00000565096 2109 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-220ENST00000461760 644 ntTSL 312.89□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 LINC01446-201ENST00000380970 3484 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.364e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SDCCAG3-207ENST00000461693 869 ntTSL 212.78□□□□□ -0.364e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-233ENST00000496159 463 ntTSL 212.76□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-209ENST00000464661 906 ntTSL 312.68□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 YWHAZ-212ENST00000480304 2247 ntTSL 212.64□□□□□ -0.398e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-212ENST00000469097 801 ntTSL 512.56□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ESYT1-201ENST00000267113 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 AP1G2-228ENST00000556966 1098 ntTSL 312.44□□□□□ -0.424e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MYO19-226ENST00000621550 4299 ntTSL 512.37□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 POLG-221ENST00000637238 3022 ntTSL 512.3□□□□□ -0.444e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SMARCAD1-204ENST00000457823 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.444e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 CNN2-211ENST00000606983 537 ntTSL 312.09□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 UVSSA-204ENST00000505716 549 ntTSL 312.08□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 NAB1-209ENST00000448811 590 ntTSL 412.06□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 LIPE-AS1-208ENST00000599276 251 ntTSL 511.86□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.524e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 POLG-222ENST00000637264 3153 ntTSL 511.8□□□□□ -0.524e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SLC6A6-207ENST00000618278 6401 ntTSL 511.79□□□□□ -0.524e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MYO19-207ENST00000611622 4226 ntTSL 1 (best)11.71□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RNF123-201ENST00000327697 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.544e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RNF123-207ENST00000457726 4506 ntTSL 1 (best)11.56□□□□□ -0.564e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.574e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 NAB1-204ENST00000416973 568 ntTSL 411.32□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TP53BP1-210ENST00000450115 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PPP2R5C-212ENST00000554442 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 HM13-214ENST00000472128 865 ntTSL 511.01□□□□□ -0.654e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.654e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.657e-8■■■■■ 30.6
AARSP49588 TP53BP1-207ENST00000417342 594 ntTSL 310.8□□□□□ -0.684e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-213ENST00000526133 367 ntTSL 210.78□□□□□ -0.684e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TP53BP1-211ENST00000467474 556 ntTSL 310.73□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TP53BP1-216ENST00000572085 5574 ntTSL 210.56□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.744e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-206ENST00000413760 801 ntTSL 310.36□□□□□ -0.754e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.754e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 AP1G2-212ENST00000554554 2955 ntTSL 210.34□□□□□ -0.754e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SDCCAG3-208ENST00000466579 496 ntTSL 1 (best)10.3□□□□□ -0.764e-6■■■■■ 30.6
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AARSP49588 TP53BP1-204ENST00000411772 3976 ntTSL 59.94□□□□□ -0.824e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RBBP4-201ENST00000373485 1417 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.834e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.834e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.844e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 39.76□□□□□ -0.854e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 GIGYF2-204ENST00000409480 5976 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.854e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SZT2-207ENST00000471177 574 ntTSL 49.42□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.934e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-255ENST00000534804 555 ntTSL 49.14□□□□□ -0.954e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.954e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.984e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 POLG-207ENST00000528881 524 ntTSL 58.73□□□□□ -1.014e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.044e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.064e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ZNF282-201ENST00000462740 223 ntTSL 58.35□□□□□ -1.074e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RABGAP1L-211ENST00000465412 710 ntTSL 58.3□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 WDR1-201ENST00000264785 549 ntTSL 47.81□□□□□ -1.164e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.184e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PPP2R5C-215ENST00000556068 3363 ntTSL 27.49□□□□□ -1.214e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RBBP4-214ENST00000492348 1547 ntTSL 27.45□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 GIGYF2-231ENST00000474312 4687 ntTSL 27.38□□□□□ -1.234e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.274e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SMARCAD1-203ENST00000394961 3778 ntTSL 26.89□□□□□ -1.314e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.314e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RBBP4-208ENST00000463378 882 ntTSL 56.84□□□□□ -1.314e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RABGAP1L-212ENST00000469553 2103 ntTSL 1 (best)6.56□□□□□ -1.364e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.374e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.434e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ESYT1-205ENST00000550179 576 ntTSL 46.01□□□□□ -1.454e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SETD2-201ENST00000330022 8172 ntTSL 1 (best)5.93□□□□□ -1.464e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SETD2-204ENST00000431180 7555 ntTSL 25.8□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 USP34-211ENST00000472706 556 ntTSL 45.79□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.524e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RABGAP1L-220ENST00000529145 722 ntTSL 45.08□□□□□ -1.64e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.614e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.644e-6■■■■■ 30.6
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