Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA8P48165 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA8P48165 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA8P48165 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA8P48165 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA8P48165 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA8P48165 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA8P48165 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA8P48165 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA8P48165 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA8P48165 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA8P48165 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA8P48165 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA8P48165 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA8P48165 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA8P48165 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA8P48165 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA8P48165 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA8P48165 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA8P48165 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA8P48165 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA8P48165 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA8P48165 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA8P48165 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA8P48165 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA8P48165 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA8P48165 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA8P48165 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA8P48165 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA8P48165 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA8P48165 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJA8P48165 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJA8P48165 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA8P48165 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA8P48165 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA8P48165 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA8P48165 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA8P48165 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA8P48165 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA8P48165 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA8P48165 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA8P48165 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA8P48165 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA8P48165 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA8P48165 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA8P48165 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA8P48165 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA8P48165 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA8P48165 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA8P48165 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA8P48165 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms