Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 DEF8-227ENST00000570182 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DEF8-201ENST00000268676 3725 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 DEF8-229ENST00000617948 3883 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 34.4
GTF2F1P35269 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.152e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 PPFIA1-222ENST00000532504 5159 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 PPFIA1-207ENST00000526347 862 ntTSL 512.8□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 PPFIA1-214ENST00000530390 879 ntTSL 512.27□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 PPFIA1-211ENST00000528750 1168 ntTSL 510.3□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 PPFIA1-213ENST00000530294 977 ntTSL 510.3□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 PPFIA1-206ENST00000526262 4537 ntTSL 1 (best)9.44□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 PPFIA1-217ENST00000530798 710 ntTSL 57.63□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 PPFIA1-205ENST00000526074 573 ntTSL 36.86□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 PPFIA1-224ENST00000533894 553 ntTSL 45.38□□□□□ -1.552e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 ACSS3-208ENST00000616449 3833 nt14.58□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 ACSS3-206ENST00000549175 534 ntTSL 514.08□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 PLCXD1-210ENST00000448477 828 ntTSL 215.46■□□□□ 0.079e-9■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 ALOX12-AS1-205ENST00000572385 576 ntTSL 414.54□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 ALOX12-AS1-203ENST00000570562 567 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 DLGAP4-208ENST00000478910 2674 ntTSL 217.16■□□□□ 0.342e-9■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 DLGAP4-210ENST00000479951 631 ntTSL 314.9□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 DLGAP4-213ENST00000489701 2396 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.192e-9■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 DLGAP4-209ENST00000479220 577 ntTSL 313.75□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 34.3
GTF2F1P35269 WDR33-203ENST00000408998 583 ntTSL 421.93■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 WDR33-205ENST00000436787 822 ntTSL 515.81■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 WDR33-204ENST00000409658 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 WDR33-202ENST00000393006 3574 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.381e-6■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 CNNM4-204ENST00000496186 748 ntTSL 310.46□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.116e-7■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.776e-7■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 TMEM120B-201ENST00000342607 2766 ntTSL 227.34■■□□□ 1.973e-10■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.123e-10■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 TMEM120B-207ENST00000541467 2959 ntTSL 513.26□□□□□ -0.293e-10■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.826e-7■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)26.12■■□□□ 1.776e-7■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.286e-7■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.031e-10■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 CCT6P3-202ENST00000426828 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 34.2
GTF2F1P35269 SPOPL-203ENST00000430968 558 ntTSL 526.95■■□□□ 1.92e-22■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.133e-9■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.022e-9■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.022e-9■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.942e-9■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ESPN-214ENST00000633239 1494 ntTSL 519.67■□□□□ 0.742e-9■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ESPN-207ENST00000475228 813 ntTSL 519.24■□□□□ 0.672e-9■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 BCL2L2-206ENST00000557579 596 ntTSL 316.67■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 BCL2L2-203ENST00000554635 545 ntTSL 1 (best)14.73□□□□□ -0.052e-9■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 BCL2L2-202ENST00000553824 548 ntTSL 413.49□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ESPN-208ENST00000475479 360 ntTSL 310.87□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 DSCR4-201ENST00000328264 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.463e-7■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.363e-7■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 PCSK6-203ENST00000557794 1196 ntTSL 512.49□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.682e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 C11orf95-203ENST00000445014 827 ntTSL 530.64■■■□□ 2.52e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.092e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATP13A3-205ENST00000457986 490 ntTSL 327.64■■■□□ 2.022e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.952e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.762e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 KIAA0100-215ENST00000583403 1271 ntTSL 1 (best)24.52■■□□□ 1.522e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.492e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 C11orf95-201ENST00000338498 723 ntTSL 1 (best)24.03■■□□□ 1.442e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.272e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.262e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.216e-7■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 SNRPE-206ENST00000483099 967 ntTSL 222.53■■□□□ 1.22e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.191e-9■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 TIPARP-203ENST00000473702 1770 ntTSL 222.28■■□□□ 1.162e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.152e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.132e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.112e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.12e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 BX322557.1-201ENST00000454115 389 ntTSL 1 (best)21.94■■□□□ 1.12e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.052e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.042e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 RAB4B-207ENST00000602069 587 ntTSL 521.4■■□□□ 1.022e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 SEPT9-243ENST00000592407 509 ntTSL 221.29■■□□□ 12e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 CHERP-204ENST00000546538 1429 ntTSL 1 (best)21.19■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 AMPD2-210ENST00000476688 1111 ntTSL 321.14■□□□□ 0.972e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 RAB4B-206ENST00000600078 715 ntTSL 520.96■□□□□ 0.952e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 NFATC1-213ENST00000590313 1919 ntTSL 220.72■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 TUBA3FP-201ENST00000292748 1678 ntTSL 520.51■□□□□ 0.872e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-221ENST00000483778 1103 ntTSL 320.46■□□□□ 0.872e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.82e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 KIAA0100-205ENST00000577417 1839 ntTSL 1 (best)19.61■□□□□ 0.732e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 FCHO1-230ENST00000600058 910 ntTSL 219.52■□□□□ 0.723e-6■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 FCHO1-229ENST00000599766 747 ntTSL 319.52■□□□□ 0.723e-6■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 AC136475.3-201ENST00000533924 309 ntTSL 518.79■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 34.1
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 103 ms