Protein–RNA interactions for Protein: P34897

SHMT2, Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHMT2P34897 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHMT2P34897 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHMT2P34897 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SHMT2P34897 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SHMT2P34897 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHMT2P34897 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHMT2P34897 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHMT2P34897 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHMT2P34897 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHMT2P34897 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SHMT2P34897 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHMT2P34897 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms