Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms