Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DPA1P20036 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DPA1P20036 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DPA1P20036 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DPA1P20036 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DPA1P20036 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DPA1P20036 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DPA1P20036 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms