Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPGDP15428 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPGDP15428 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPGDP15428 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPGDP15428 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPGDP15428 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPGDP15428 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPGDP15428 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPGDP15428 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPGDP15428 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPGDP15428 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPGDP15428 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPGDP15428 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPGDP15428 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPGDP15428 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPGDP15428 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPGDP15428 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPGDP15428 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPGDP15428 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HPGDP15428 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPGDP15428 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPGDP15428 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPGDP15428 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPGDP15428 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPGDP15428 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPGDP15428 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPGDP15428 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPGDP15428 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms