Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNRPBP14678 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms