Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMIM6P0DI80 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM6P0DI80 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms