Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTMAP06454 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTMAP06454 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTMAP06454 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTMAP06454 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTMAP06454 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTMAP06454 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTMAP06454 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTMAP06454 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTMAP06454 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTMAP06454 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTMAP06454 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTMAP06454 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTMAP06454 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTMAP06454 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTMAP06454 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTMAP06454 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTMAP06454 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTMAP06454 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTMAP06454 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTMAP06454 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTMAP06454 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTMAP06454 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTMAP06454 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTMAP06454 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTMAP06454 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTMAP06454 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTMAP06454 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTMAP06454 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTMAP06454 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTMAP06454 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTMAP06454 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTMAP06454 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTMAP06454 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTMAP06454 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTMAP06454 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTMAP06454 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTMAP06454 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTMAP06454 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTMAP06454 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTMAP06454 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTMAP06454 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTMAP06454 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTMAP06454 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTMAP06454 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTMAP06454 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTMAP06454 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTMAP06454 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTMAP06454 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTMAP06454 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTMAP06454 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTMAP06454 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTMAP06454 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTMAP06454 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTMAP06454 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTMAP06454 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTMAP06454 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTMAP06454 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTMAP06454 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTMAP06454 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMAP06454 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMAP06454 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMAP06454 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMAP06454 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMAP06454 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMAP06454 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMAP06454 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMAP06454 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMAP06454 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMAP06454 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTMAP06454 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMAP06454 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMAP06454 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMAP06454 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMAP06454 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTMAP06454 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMAP06454 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMAP06454 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMAP06454 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMAP06454 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMAP06454 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMAP06454 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMAP06454 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMAP06454 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMAP06454 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMAP06454 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTMAP06454 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMAP06454 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMAP06454 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMAP06454 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMAP06454 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMAP06454 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMAP06454 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMAP06454 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMAP06454 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMAP06454 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMAP06454 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMAP06454 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMAP06454 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTMAP06454 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms