Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT18P05783 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT18P05783 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT18P05783 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT18P05783 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT18P05783 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT18P05783 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT18P05783 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT18P05783 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT18P05783 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT18P05783 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT18P05783 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT18P05783 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT18P05783 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT18P05783 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT18P05783 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT18P05783 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT18P05783 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT18P05783 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT18P05783 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT18P05783 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT18P05783 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT18P05783 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT18P05783 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT18P05783 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT18P05783 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT18P05783 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT18P05783 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT18P05783 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT18P05783 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT18P05783 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT18P05783 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT18P05783 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT18P05783 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT18P05783 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT18P05783 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT18P05783 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT18P05783 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT18P05783 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT18P05783 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT18P05783 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT18P05783 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT18P05783 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT18P05783 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT18P05783 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT18P05783 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms