Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24BO95487 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC24BO95487 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms