Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYNGR3O43761 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms