Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KNCNA6PVL3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KNCNA6PVL3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms