Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POTEFA5A3E0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POTEFA5A3E0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms