Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIPSLA2A3N6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIPSLA2A3N6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms