Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 C9orf64-201ENST00000314700 2067 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SPIN1-201ENST00000375859 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PLEKHA6-205ENST00000637508 5704 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MFAP4-201ENST00000299610 1873 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZBED9-201ENST00000452236 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 LINC00355-201ENST00000456627 1878 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ITGB8-205ENST00000537992 3420 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 IP6K3-202ENST00000451316 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 IGHV3-74-201ENST00000424969 587 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 HNRNPA1P8-201ENST00000436090 951 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TSEN2-204ENST00000415684 2279 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ELMO2-201ENST00000290246 3669 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TPT1-212ENST00000530705 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ANXA4-201ENST00000394295 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CHEK1-203ENST00000428830 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TP53TG3F-201ENST00000617705 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL590434.1-201ENST00000641402 1886 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FGD3-202ENST00000375482 3321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SCNN1A-203ENST00000360168 3481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 STYX-201ENST00000354586 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PTGS1-201ENST00000223423 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FAM200B-223ENST00000622362 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZNHIT6-201ENST00000370574 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms