Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAX2Q9UIW0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 608 ms