Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms