Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TIMMDC1Q9NPL8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms