Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
YIPF3Q9GZM5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
YIPF3Q9GZM5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
YIPF3Q9GZM5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
YIPF3Q9GZM5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
YIPF3Q9GZM5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
YIPF3Q9GZM5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms