Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SALL3Q9BXA9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SALL3Q9BXA9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms