Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYCBPQ99417 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYCBPQ99417 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms