Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP205Q92621 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP205Q92621 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms