Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
U2AF1L4Q8WU68 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
U2AF1L4Q8WU68 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms