Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LGI3Q8N145 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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LGI3Q8N145 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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LGI3Q8N145 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LGI3Q8N145 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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