Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYB3

SRRM1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 904 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM1Q8IYB3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM1Q8IYB3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRRM1Q8IYB3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRRM1Q8IYB3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRRM1Q8IYB3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRM1Q8IYB3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms