Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD1Q6UXZ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD1Q6UXZ0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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